С 18 по 22 мая 2015 г. в НОЦ «AWTech» состоялись курсы повышения квалификации «Основы молекулярной генетики: ПЦР, секвенирование, биоинформатика, генотипирование и ГМО-диагностика».
Задача данного недельного курса - донести до слушателей основные требования к организации ПЦР-лаборатории и молекулярно-генетических исследований согласно международным и отечественным требованиям, а также освоить на практических занятиях современные методики по проведению молекулярно-генетической диагностики от пробоподготовки до интерпретации результатов.
Лекции читали сертифицированные специалисты и эксперты НОЦ «АВТех»: Гончар Мария Владимировна, к.х.н., зам. Генерального директора по науке, НОЦ «АВТех»; Горелов Петр Валерьевич, к.б.н., руководитель проекта Life Science; Спиридонова Ольга Андреевна, руководитель проектов; Щербинин Дмитрий Сергеевич, к.б.н., эксперт; Егоров Алексей Александрович, к.т.н., начальник департамента аттестации и испытаний.
Лекции читали также приглашенные лектора из других учреждений: Балацкий Александр Владимирович, к.м.н., биологический факультет МГУ имени М.В.Ломоносова; Мария Белякова, к.б.н., «НПК Медиана-Фильтр»; Смирнова Мария Александровна, научный сотрудник лаборатории генетики ФГБУ Институт океанологии им. П.П. Ширшова РАН.
Практические занятия вели специалисты ФГБНУ Всероссийского научно-исследовательского института экспериментальной ветеринарии им. Я.Р. Коваленко: Завьялова Елена Александровна, к.б.н., заведующая лабораторией; Дрошнев Алексей Евгеньевич, к.б.н.; Богданова Полина Дмитриевна.
Расписание курса с указанием названий лекций и именами лекторов можно скачать, пройдя по следующей ссылке
Гончар М. В., к.х.н., зам. Генерального директора по науке, директор НОЦ «АВТех» | Горелов П.В., к.б.н., руководитель проекта Life Science АНО «АВТех» | Балацкий А. В., к.м.н., биологический факультет МГУ имени М.В.Ломоносова |
Щербинин Д. С., к.б.н., эксперт АНО «АВТех» | На лекциях | Егоров А. А., к.т.н., начальник департамента аттестации и испытаний АНО «АВТех» |
Спиридонова О. А., руководитель проектов АНО «АВТех» | Смирнова М. А., научный сотрудник лаборатории генетики ФГБУ Институт океанологии им. П.П. Ширшова РАН | Белякова М., к.б.н., «НПК Медиана-Фильтр» |
Программа теоретического курса охватывала следующие темы:
- История развития молекулярной генетики. Прошлое, настоящее, будущее. Современные научные направления, тенденции. ПЦР. Обзор. Принципы работы. Особенности. Проблемы. Развитие методов молекулярной генетики. Структура ДНК/РНК.
- История развития и применение ГМО-технологии. Современные правовые аспекты.
- История развития приборной базы для ПЦР анализа. Современные приборы.
- Организация ПЦР-лаборатории согласно международным и отечественным требованиям. Концептуальный дизайн-проект.
- Основные источники ошибок при проведении молекулярно-генетических исследований. Контроль качества в работе генетических лабораторий.
- Пробоподготовка, транспортировка и консервация образцов.
- Вода для молекулярно-генетических исследований.
- Современные методы выделения ДНК/РНК: обзор.
- Принципы выделения ДНК/РНК. Методические особенности.
- Спектрофотометрический анализ. Оценка качества выделенной ДНК/РНК.
- Методы детекции ПЦР. Практические рекомендации. Составление протоколов.
- Технология постановки ПЦР с различными вариантами детекции результатов;
- Гибридизационно-флуоресцентный метод детекции. Особенности, проблемы и преимущества данного метода в практическом применении.
- Молекулярно-биологические основы мультифакторных определений (генетические исследования);
- Практические моменты по подбору реакционных смесей, постановки ПЦР реакции. Интерпретация результатов молекулярно-генетического анализа.
- Новые методы ПЦР диагностики. Цифровая ПЦР. Микрочиповые технологии.
- Секвенирование. История развития методов секвенирования. Сравнительная характеристика.
- Методы ПЦР и секвенирования в популяционной генетике на примере тихоокеанской трески Gadus macrocephalus.
- Обработка данных. Программное обеспечение. Статистические программы. Графики. Гистограммы.
- Биоинформатика. Применение компьютерных методов для решения биологических задач.
- Базы данных: обработка, интерпретация и практическое применение.
- Номенклатура генетических замен. Программы для проверки патогенности замен.
- Генотипирование и ГМО-диагностика.
- Автоматизация исследований в лаборатории. Методы. Оборудование.
- Экспресс-методы ПЦР диагностики в лабораторной практике.
В рамках теоретического курса было продемонстрированно большое количество эксклюзивных видеоматериалов.
Практические занятия проходили на базе ФГБНУ Всероссийского научно-исследовательского института экспериментальной ветеринарии им. Я.Р. Коваленко.
Первый день практики начался с обзорной экскурсии по лаборатории ихтиопатологии, потом был проведен инструктаж, включающий подробное руководство по принципам организации правильной работы в боксе биологической безопасности, правилам пипетирования и др.
В рамках практикума каждый слушатель под руководством Завьяловой Е. А. и Богдановой П. Д. производил выделение ДНК/РНК с последующей спектрофотомерией, постановку ПЦР и гибридизационно-флуоресцентной детекцией.
Слушатели курса на практических занятиях в лаборатории ихтиопатологии ФГБНУ ВНИИ экспериментальной ветеринарии им. Я.Р. Коваленко |
Работа с амплификаторами TProfessionalTRIO и (Analytik Jena) и Real-Time амплификатор qTOWER 2.0/2.2 под руководством и Богдановой П. Д. | |
Анализ продуктов ПЦР с помощью метода гель-электрофореза под руководством Завьяловой Е. А. | Общая фотография в лаборатории ихтиопатологии ФГБНУ Всероссийского научно-исследовательского института экспериментальной ветеринарии им. Я.Р. Коваленко. |
По окончании курса было проведено тестирование, по успешным результатам которого слушателям были выданы удостоверения о повышении квалификации установленного образца.