6 октября 2017 года завершил свою работу курс повышения квалификации «Биоинформатика: Основы и практическое применение компьютерных подходов для решения биологических задач»
Курс обучения предназначен для повышения профессионального уровня руководителей, работников биотехнологических лабораторий и лабораторий молекулярной диагностики, сотрудников селекционных центров, фармацевтической отрасли и других специалистов в области молекулярной биологии, работа которых связана с исследованием белков и нуклеиновых кислот.
Цель курса: расширение знаний и ознакомление слушателей с основными методами и подходами биоинформатики при работе с различными биологическими данными; получение навыков работы с ключевыми биоинформатическими базами данных белков и нуклеиновых кислот; использования современных математических и статистических подходов в молекулярно - биологических, фармакологических и медицинских исследованиях для решения широкого спектра задач: поиск кодирующих и регуляторных участков в ДНК; определение и исследование влияний точечных мутаций; предсказание строения и функций новых белков; поиск перспективных мишеней для разработки лекарств; направленная разработка и оптимизация новых лекарственных средств.
Читал все лекции и проводил практические занятия Щербинин Дмитрий Сергеевич, к.б.н., (Сколтех, ООО “АйтиБиотек”).
В программу осеннего курса «Биоинформатика: Основы и практическое применение компьютерных подходов для решения биологических задач» вошли следующие темы:
- Биоинформатика. Основные направления и подходы.
- Банки данных нуклеотидных данных. NCBIGenebank, Nucleotides, RefSeq. Формат Fasta (с практическим занятием).
- Банки данных информации о белках. Uniprot (с практическим занятием).
- Работа с последовательностями белков и нуклеиновых кислот. Выравнивание последовательностей (парное и множественное; локальное и глобальное) BLAST (с практическим занятием).
- Доменная организация белков. Белковые семейства. Pfam, InterPro.
- Белок-белковые взаимодействия. Сети.
- Изучение экспрессии генов.
- Пространственные структуры белков и нуклеиновых кислот. Методы получения. PDB
- Основы методов молекулярной динамики. Применение МД.
- Поиск конформаций комплексов белок-лиганд, белок-белок и белок-ДНК(РНК). Молекулярный докинг.
Каждая тема сопровождалась практическими задачами, для решения которых слушатели использовали специализированное современное программное обеспечение.
С расписанием курса с указанием тем лекций и Ф.И.О лекторов можно ознакомиться, перейдя по ссылке: http://www.awtec.ru/images/raspisanie_bioinformatika_2017.MV.pdf
Курс повышения квалификации «Биоинформатика: Основы и практическое применение компьютерных подходов для решения биологических задач» прошли представители следующих организаций:
-
Федеральное государственное бюджетное учреждение «Всероссийский центр карантина растений» (ФГБУ «ВНИИКР»).
-
Федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего образования «Санкт-Петербургская государственная химико-фармацевтическая академия» Минздрава России.
-
ФГАОУ ВО «Южный федеральный университет», Академия биологии и биотехнологии им. Д.И. Ивановского, кафедра биохимии и микробиологии.
-
ЗАО «Евроген».
-
Институт общей генетики им. Н.И. Вавилова РАН.
-
ООО «НПО «Русагро-Семена».
По завершении курсов было проведено письменное тестирование, по результатам которого слушатели получили удостоверения о повышении квалификации установленного образца.
Слушатели курса высоко оценили учебную программу и профессиональный уровень лекторов. Отзывы о курсах НОЦ «АВТех» можно почитать здесь: http://www.awtec.ru/noc/responses/